۲۳ آبان ۱۴۰۴
به روز شده در: ۲۳ آبان ۱۴۰۴ - ۰۱:۳۰
فیلم بیشتر »»
کد خبر ۱۰۲۰۰۷۲
تاریخ انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳
کد ۱۰۲۰۰۷۲
انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

«پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنباله‌های پروتئینی در شبکه‌های مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.

به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

وی ادامه داد: بنابراین در کنار روش‏‌های آزمایشگاهی، از روش‌های محاسباتی نیز استفاده می‌‏شود. از روش‌های محاسباتی که برای پیش‌بینی بهترین کاندیدای داروها استفاده می‌‏شود، می‌‏توان به روش‌های سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روش‏‌ها می‌توان داروهای تأثیرگذار را پیش‌بینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.

این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین می‌شود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه‌ کشف دارو دارد.

وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا می‌‏توان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهره‌‏گیری از دانش اضافی موجود در مجموعه داده‌ها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها طراحی کرد؟

عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیش‌بینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.

برچسب ها: دارو ، یادگیری عمیق
ارسال به دوستان
ورود کد امنیتی
captcha
این ماده می‌تواند تا ۲۰۰۰ درجه حرارت را تحمل کند؛ ناسا آن را از چه چیزی ساخته است؟ قانون ژاپنی ۶-۶-۶ یک استراتژی موثر ضد پیری درگیری شدید نیروهای دولت موقت و دروزی‌های سوریه یک فروند جنگنده سوخو-۳۰ در روسیه سقوط کرد قلعه‌نویی: به پک بیایید و به من مشورت بدهید؛ دوست دارم با مصر بازی کنیم دادستان ملایر: خودکشی یکی از زندانیان کذب است مصطفی مستور راز انتخاب نام کتابش را برملا کرد  حمله عربستان به صعده یمن سفیر تل‌آویو در آمریکا: ترکیه نباید اف-۳۵ دریافت کند نماینده خبرگان رهبری خوزستان: دستور دلسوزانه رییس‌جمهور موجب آرامش مردم خوزستان شد  روسیه: روابط میان مسکو و برلین به پایین‌ترین سطح خود رسیده است امانوئل استکهلم؛ آجر و هندسه در معماری مذهبی (+عکس) ادعای کانادا: در سال جاری چندین «تهدید بالقوه مرگبار» از سوی ایران را خنثی کردیم سرمربی کیپ‌ورد: ایران آینده خوبی در جام جهانی دارد ماجرای ناخدایی که مسافرانش را در دریا غرق کرد